由于异养消耗和缺乏来自含氧表层的补给，分层倾向于导致深层水库水的脱氧。当大坝进水口比氧跃层深时，缺氧水可通过下游。由于氧气在较温暖的水中的溶解性较低，因此纬度较低的大坝比位于高纬度的大坝面临更严重的深层水缺氧问题。

水库的物理化学影响

水库分层形成的影响与大坝泄水口的高度紧密相关，对于温度、可溶性营养盐（氮）、不可溶营养物质（磷、硅）等都是如此。富磷深水的排放可能会在下游河段造成类似的水华，但若水库泄水造成水体垂向混合，水库缺氧也会促进库首下游水华发生。

水库水体分层，底层水缺氧会在水库沉积物中引发一系列厌氧氧化还原过程，包括磷的再活化和可溶性还原化合物的生成。磷的再活化，氧化铁颗粒是溶解水的强吸收剂，但在缺氧条件下，铁作为电子受体被还原成可溶的亚铁形式。在铁还原过程中，铁结合的P也变得可溶，并释放到溶液中，生物有效磷的突然增加会刺激水库表层发生水华。水库分层在不同纬度普遍存在，大多数水库至少会在季节性基础上分层；另一方面，许多水库还能够有效地截留沉积物和推移质，改变或破坏水库上游和下游的水质和生态系统。了解大坝对河流水质影响的关键是准确了解水库温跃层/氧跃层相对于溢洪道或涡轮机进水口的深度。

飓风型扬水曝气器向超深层水体中通入的压缩空气不但为水库提供必要的氧，还为水库的循环提供了动力，打破水体分层。飓风型扬水曝气器循环原理：向上升管内通入压缩空气。由于气提作用，液体开始循环。并向上升管内通入一定量的辅助空气来维持循环。

飓风型扬水曝气器运行，造成水库热分层逐渐破坏，表层氮磷营养盐水平降低，混合层深度增加，均对藻类产生影响。扬水曝气器运行期间，表层藻细胞密度降低，底层藻细胞密度增加，藻类数量的垂向分层逐渐减弱，水中氮营养盐的改变对藻类生物量的影响较显著。扬水曝气器运行使水库蓝藻优势降低，硅藻上升为优势种群，藻类群落结构在垂向上无明显差异，水库藻类多样性水平提高，水体生态状况良好。氮营养盐、热分层结构和光照条件的改变，均对藻类群落结构的影响较大。